勅許を得ないままの条約調印、将軍継嗣の強引な決定。これらを推し進めた大老の井伊直弼に対し、雄藩大名や尊皇攘夷論達は激しく非難した。一方の井伊も、批判者に対しては将軍家の一族であろうと公家であろうと容赦なく罰し始めたのである。
まず、御三家・水戸藩の前藩主・徳川斉昭は水戸にて永蟄居。御三卿の流れを汲む越前藩主・松平慶永（春嶽）らは隠居・慎を命じられた。また、越前藩士の橋本左内、松下村塾の吉田松陰、儒学者の頼三樹三郎（らい みきさぶろう）らは死罪となった。この事件を安政の大獄（あんせいのたいごく）という。
井伊の弾圧政策は尊攘派の反感を強め、後に大事件に発展する。
安政の大獄の主な処罰者をまとめると、以下の通り。
|
・徳川斉昭（前水戸藩主）：水戸にて永蟄居 |
|
|
・岩瀬忠震（作事奉行）：隠居・慎 |
|
|
・橋本左内（越前藩士）：死罪 |
|
|
・近衛忠煕（このえ ただひろ）（左大臣）：辞官・落飾・慎 |
|
|
・頼三樹三郎（儒者）：死罪 |
上記の通り、主だった人物だけでもかなりの数である。幕臣・藩士に限らず、大名や公家まで多数処罰対象にしたこの事件は、異例の事態と見ていいだろう。
なお、三条実万は三条実美（さんじょう さねとみ）の父。頼三樹三郎は尊王論を唱えた頼山陽（らい さんよう）の息子である。
吉田松陰は私塾・松下村塾の塾頭で、高杉晋作（たかすぎ しんさく）はじめ、多くの尊攘・討幕の志士を輩出しており、師の思想は弟子達に受け継がれた。